华佗是在狱中拷问致死的，算是被曹操下令杀死的。
华佗以医术为业，心中常感懊悔（中国封建社会中医生属于“方技”，被视为“贱业”）。后来曹操亲自处理国事，得病（头风）沉重，让华佗专门为他治疗。华佗说：“这病在短期之内很难治好，即便是长期治疗也只能延长寿命。”
华佗因为离开家太久想回去，于是说：”收到一封家书，暂时回去一趟。“到家之后，就说妻子病了，多次请求延长假期而不返。之后曹操三番五次写信让华佗回来，又下诏令郡县征发遣送，华佗自持有才能，厌恶为人役使以求食，仍然不上路。
曹操很生气，便派人去查看；如果他妻子真的病了，便赐小豆四千升，放宽假期期限；如果欺骗，就逮捕押送。结果华佗撒谎，于是用传车把华佗递解交付许昌监狱，经审讯验实，华佗供认服罪。
荀彧向曹操求情说：“华佗的医术确实高明，关系着人的生命，应该包涵宽容他。”曹操说：“不用担忧，天下就没有这种无能鼠辈吗？”终于把华佗在狱中拷问致死。
华佗是被谁下令处死的 扩展
一代神医华佗在正史上怎么死的没有明确记载，在《三国演义》里，是被曹操曹操曹孟德下令处死的。
因为，华佗给曹操看病时，说要剖开曹操的头颅给他治疗偏头疼，曹操怀疑华佗要害自己给关羽报仇，因此下令把华佗关进大牢，后来又下令处死。
